Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWA5B1Q5TIE3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWA5B1Q5TIE3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms