Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEND3Q5T5X7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms