Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms