Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms