Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN4Q5BKX8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms