Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC2Q56P42 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC2Q56P42 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms