Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms