Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA8Q53HL2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms