Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms