Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM259Q4ZIN3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms