Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms