Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF1Q3BBV0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms