Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HFEQ30201 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HFEQ30201 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms