Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ISXQ2M1V0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms