Protein–RNA interactions for Protein: Q1W4C9

SPINK13, Serine protease inhibitor Kazal-type 13, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK13Q1W4C9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPINK13Q1W4C9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPINK13Q1W4C9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms