Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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