Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IMPG1Q17R60 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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