Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD1Q16881 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD1Q16881 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms