Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2SQ16763 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms