Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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