Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SGCBQ16585 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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