Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms