Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms