Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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