Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TWIST1Q15672 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TWIST1Q15672 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms