Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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