Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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