Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIN2CQ14957 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms