Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GBX1Q14549 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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