Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms