Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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