Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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