Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CKAP5Q14008 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CKAP5Q14008 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CKAP5Q14008 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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