Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms