Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
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SHROOM2Q13796 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHROOM2Q13796 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
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