Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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