Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKD2Q13563 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2Q13563 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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