Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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