Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDAP1Q13442 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDAP1Q13442 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms