Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATMQ13315 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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