Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms