Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMAGPQ0VAQ4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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