Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms