Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms