Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms