Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC18A2Q05940 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms