Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms