Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms