Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XPCQ01831 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms