Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSG4Q00888 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms